医药卫生系是“全国第二批急救教育试点校”、“内蒙古自治区养老服务人才培养基地”、“内蒙古自治区科普教育示范基地”、“呼和浩特市紧缺人才培训基地”的主要依托单位。现有在校生1449人，每年招生数量稳定在470人左右。
医药卫生系秉承“学高为师，身正为范”，拥有一支结构合理、专兼结合、理论扎实、技能过硬的教师团队。现有教职工126人，其中专任教师100人，医护人员9人。专任教师中博士10人，硕士46人，在读博士1人，教授8人，副教授31人，“双师”型教师54人。有国家级教指委委员3人，自治区级职业教育教师创新团队1个，自治区新世纪“321”人才3人，校级专业（群）带头人7人，校级教学名师4人，教坛新秀3人。
医药卫生系开设有药品生物技术(含中草药种植与加工技术方向)、食品生物技术、护理、康复治疗技术、健康管理5个专业6个方向。经过多年建设，现有国家创新行动计划骨干专业1个，自治区高水平专业群1个，自治区特色专业1个，为自治区生物医药产业发展提供人才支撑。学生在全国和自治区职业院校各类技能大赛、“挑战杯”科技作品竞赛、“互联网+”创新创业大赛中获奖20余项，人才培养质量逐年提高。
目前，建成自治区级专业教学资源库1个，自治区级精品在线开放课1门，院级优质资源课7门，精品在线开放课2门，校级“金课”13门，成功认定养老照护、食品合规管理等“1+X”考核站点。获自治区职业教育教学成果一等奖1项，自治区教学能力比赛一等奖2项、二等奖1项，自治区信息化教学大赛二等奖1项。校级教育教学成果奖2项，在课程思政、教学能力比赛、青年教师教学能力比赛等各类比赛中获奖20余项。
医药卫生系拥有先进的实训条件，能满足各专业的实训要求。现有生物制品生产线、发酵工程生产线及药品食品检验检测实训室、基础护理实训室、康复治疗实训室、数字人虚拟仿真实训室，实训场所总面积约6000余平方米，设备总价值1600万元，实验实训设备1246台，总工位数906个。现有“产学研”一体的生产性实训室2间，中试生产线1条。2023年，成功认定“内蒙古自治区花青素生产工程研究中心”。
为深化产教融合、校企合作，作为理事单位参加自治区卫生健康产教融合共同体、市域产教融合共同体，与内蒙古人民医院、呼和浩特市第一医院、内蒙古大唐药业、内蒙古国药控股有限公司、内蒙古九州通医药有限公司、内蒙古金宇生物科技有限公司、内蒙古兰格格乳业有限公司等建立了良好的合作关系，截止2024年，深度合作企业有25家。同时，积极开展“校企双元”育人模式探索，共同开发双元教材7本，合作申报科研项目3项。
医药卫生系依托自治区生物医药、绿色农畜产品加工等重点产业，开展学术研究。近年来，获批自治区自然科学基金、人才开发基金、自治区高校科技计划项目、呼和浩特市科技开发项目等20余项，累积到校经费200余万元。获授权专利10余项，发表论文60余篇，其中SCI、EI6篇，为生物医药领域开展相关研究奠定基础；1人获评自治区青年创新人才奖；2023年，被呼和浩特市科学技术局授予“奶牛养殖废弃物资源化利用技术”创新联合体。充分发挥师资团队研究优势，积极开展企业科技服务项目，现有“企业科技特派员”11名，自治区“三区人才”科技计划人员1名，探索了“产学研用”一体化实践教学模式，为内蒙古蒙草草业科技有限公司、内蒙古兰格格乳业有限公司、内蒙古乌骨羊生物科技有限公司等10余家企业开展技术服务和技术研发，签订横向课题13项，累积金额260余万元，受到社会和企业的一致好评。
医药卫生系生物标本馆是集教学、科研、科普宣传和社会服务为一体的多功能标本馆。自2018年面向社会正式开放以来，承担学院各级参观接待任务，先后被评为内蒙古自治区科学技术协会“科普教育基地”和内蒙古自治区科学技术厅“生物铸型标本科普示范基地”荣誉称号。依托系部优质教学资源，积极开展社会服务，面向社区、中小学、企业开展应急救护、家庭用药指导、养老护理培训、食品药品检验检测等培训项目，累积为社会服务与培训1万余人。
